מכון נפתלי הוא המכון הוותיק ביותר בישראל בתחום זיהוי כתב היד - גרפולוגיה משפטית.

המכון נוסד על ידי ד"ר אריה נפתלי, שהיה מי שהקים את המעבדות לזיהוי פלילי במשטרת ישראל, עם קום המדינה ואשר ייסד את האגודה הישראלית לגרפולוגיה מדעית. כיום מנוהל המכון, באגף של זיהוי כתב היד, על ידי עו"ד יונתן נפתלי, המנוסה גם בתחום המשפטי ובהכנת חקירות נגדיות.

 
המכון פועל בעיקר עם בתי המשפט ברחבי ישראל, בערכאות השונות. מכון נפתלי מופיע ברשימות המומחים של בתי המשפט וממונה כמומחה מטעם בתי המשפט בתחום זיהוי כתב היד או תחת המונח גרפולוגיה משפטית.
 

מכון נפתלי מבצע בדיקות מסמכים, על פי מינוי של בתי המשפט – מחוזיים, בתי משפט השלום, בתי משפט לענייני משפחה, בתי הדין לעבודה וכן בתי הדין הרבניים.

כמו כן מבצע המכון בדיקות עבור מוסדות ממשלה שונים, אוניברסיטות, מכללות, חברות ביטוח, בנקים, עורכי דין ועוד. על לקוחות מכון נפתלי נמנים בכירי משרדי עורכי הדין ועורכי הדין בישראל.

 
מכון נפתלי פועל באופן מיקצועי, מקפיד על ביצוע בדיקות של עשרות תכונות כתב בכל מקרה ומבצע את בדיקותיו, ככל הניתן, על בסיס מסמכי מקור ומספיק דוגמאות להשוואה, לרבות דוגמאות הכתבה, הניתנות על ידי המכחיש את חתימותיו וכן דוגמאות אקראי, מתקופת מסמכי המחלוקת או מסמוך לכך.